Struktur organisasi Fakultas Ilmu Sosial berdarkan pada SK Dekan Fakultas Ilmu Sosial nomor 172a tahun 2025 tanggal 10 Agustus 2025 adalah sebagai berikut ini:
| Dekan | Prof. Dr. Mesiono, M.Pd. |
| Wakil Dekan Bidang Akademik & Kelembagaan | Dr. Retno Sayekti, MLIS. |
| Wakil Dekan Bidang Administrasi, Keuangan, dan Kepegawaian | Dr. Abdul Karim, Batubara, MA. |
| Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan & Kerjasama | M. Yoserizal, MA. |
| Kepala Bagian Administrasi Umum | Dr. Hj. Rafnitul Hasanah, MA. |
| Ketua Unit Penjaminan Mutu (UPM) | Dr. Muhammad Jailani, MA. |
| Sekretaris Unit Penjaminan Mutu (UPM) | Aulia Kamal, MA. |
| Ketua Program Studi Ilmu Komunikasi | Yusniah, MA. |
| Sekretaris Program Studi Ilmu Komunikasi | Dr. Indira Fatra Deni P., MA. |
| Ketua Program Studi Ilmu Perpustakaan | Franindya Purwaningtyas, MA. |
| Sekretaris Program Studi Ilmu Perpustakaan | Muslih Fathurrahman, MA. |
| Ketua Program Studi Sejarah Peradaban Islam | Dr. Hotmatua Paralihan Harahap, MA. |
| Sekretaris Program Studi Sejarah Peradaban Islam | Abdi Mubarak Syam, M.Hum. |
| Ketua Program Studi Sosiologi Agama | Neila Susanti, S.Sos., M.Sos. |
| Sekretaris Program Studi Sosiologi Agama | Rholand Muary, M.Sos. |